O Concílio da Igreja é o órgão máximo de decisão da Igreja Evangélica de Confissão Luterana no Brasil – IECLB. Sua tarefa é definir orientações, normas e diretrizes para que a igreja cumpra a sua missão.
O Concílio promove a reflexão sobre temas fundamentais e de interesse da igreja, estabelece plano de ação, cuida da unidade e da confessionalidade, decide sobre finanças e o orçamento central, elege o Pastor ou a Pastora Presidente e Vice-Presidentes, o Presidente ou a Presidente do próprio Concílio e Vice-Presidentes. Somente o Concílio pode modificar a Constituição, o Regimento Interno e os Regulamentos do Ministério Eclesiástico.
As normas e regulamentos definidos no Concílio valem para todos os Sínodos, Paróquias, Comunidades, Órgãos administrativos e Instituições da IECLB.
O Concílio se reúne ordinariamente a cada dois anos e extraordinariamente, quando necessário. O local de realização é definido pelo Conselho da Igreja. Comunidades, Paróquias e Sínodos que desejam sediar um Concílio enviam sua candidatura e o Conselho da Igreja faz a escolha do local.